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基因组研究揭示了儿童癌症的线索

2020-02-18 11:03:40来源:

研究人员梳理了代表1种以上20多种儿童癌症的1,700多种肿瘤的基因组,以挖掘出潜在的药物靶标,并更好地了解了最年轻患者的癌症发生方式。

该研究由两个小组于2月28日在Nature1,2上发表,是利用基因组学对抗儿童癌症的运动的一部分。在世界范围内,研究人员正在聚集在一起,分享可用于研究这些疾病的基因组学数据,技术和细胞系。

这些努力正在产生一长串可能对引发癌症很重要的遗传改变。但是,要确定这些遗传线索中的哪一条指向最佳药物靶标,将需要进行大量工作。华盛顿特区儿童抗癌倡导组织的创始人苏珊·韦纳(Susan Weiner)说:“这不仅仅是挑选基因组数据的问题。”“这里也是目标有效性的问题。” / p>

“我们有时会在孩子出生之前就看到癌症。” / h3>下载MP3

在某些方面,小儿癌症比成年癌症更容易做这项工作:儿童肿瘤倾向于积累较少的突变,从而更容易区分出真正推动肿瘤生长的遗传变化。

但是儿科癌症往往很少见,这意味着要参加临床试验的患者较少,要测序的肿瘤也较少,对为相对较小的市场开发药物感兴趣的制药公司也较少。韦纳说:“人们正在追赶成年人发展中的毒品。”

对抗癌症

为了提高他们挑选重要基因突变的能力,两组研究人员将他们在许多不同肿瘤中的数据结合在一起。由位于德国海德堡的德国癌症研究中心的科学家领导的一个小组研究了代表24种不同类型癌症的961种肿瘤1。另一位由田纳西州孟菲斯市圣裘德儿童研究医院的计算生物学家张静慧领导,分析了6种癌症中的1699种肿瘤2。样本包括血液癌症(例如白血病)和实体瘤(例如在大脑和骨骼中发现的肿瘤)。

每项研究都鉴定了140多个可能有助于促进肿瘤生长的基因。通过St Jude分析鉴定出的基因中,只有45%与在成人肿瘤分析中发现的潜在癌症驱动因素匹配。另一项研究估计其命中率的一半可能是有用的药物靶标。

数量惊人的儿童期肿瘤显示出DNA修复可能存在缺陷的迹象,类似于在成年癌症中BRCA1和BRCA2基因突变的效应。在成年人中,这类癌症正越来越多地被称为PARP抑制剂的药物治疗,该药物靶向具有异常DNA修复作用的细胞。最新研究表明,可能值得探索这些药物是否对某些儿童有效。

这些发现可能会导致检测出对儿童癌症重要的其他基因的检测,然后研究人员可以将其用于选择合适的治疗方法。目前,这些测试通常会筛查成人癌症中发现的突变,因此可能不包括儿童肿瘤特有的突变。张说:“这里没有专门针对儿童癌症的基因组。”

未来目标

但是,从鉴定突变到开发有效药物,这仍然是一条漫长的道路。

2月20日,数百名研究人员,倡导者和监管者在华盛顿举行了会议,讨论了如何实现最有希望的目标。该会议由该市的一个智囊团和游说团体癌症研究之友组织,于2017年制定了一项法律,该法律赋予美国食品药品监督管理局(FDA)权力,要求药物制造商在中国测试一些新的抗癌药物即使开发了针对成人癌症的治疗方法,也可以使儿童受益。但是要这样做,所涉及的实验药物必须具有被认为与儿童癌症“重要相关”的分子靶标。

马萨诸塞州波士顿达纳-法伯癌症研究所的儿科肿瘤学家凯瑟琳·简威说,确定该词组的含义可能很棘手。她说:“我们对癌症儿童与哪些分子靶标相关尚不了解。”

达纳-法伯(Dana-Farber)的儿科肿瘤学家斯科特•阿姆斯特朗(Scott Armstrong)表示,但为基因组学打下坚实的基础是一个有用的开始。多个实验室正试图了解此类突变如何导致癌症。例如,麻省理工学院和哈佛大学博德学院的一个大型项目是使用基因组编辑工具来系统地研究小儿癌细胞的基因功能。

阿姆斯特朗说:“这些屏幕将提供非常丰富的信息,但它们并不会成为故事的结局。”“嘿”将是更多了解正在发生的事情的开始。